Екатеринбургский филиал «Уральская государственная академия физической культуры» создан решением Учёного совета Уральской государственной академии физической культуры (УралГАФК) от 30 марта 2001 года, протокол № 7, утвержден приказом ректора УралГАФК № 26 от 06.04.2001 г, приказом Государственного комитета РФ по физической культуре, спорту и туризму от 20.03.2002 г № 126, по согласованию с Министерством образования Российской Федерации (письмо от 14.02.2002 г №04-52-14/17-14) и переименован в Екатеринбургский филиал Федерального государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Уральский государственный университет физической культуры» на основании приказов Федерального агентства по физической культуре и спорту № 117 от 01 апреля 2005 года, № 412 от 13 июля 2005 года, № 73 от 08 февраля 2006 года. Приказом Министерства спорта, туризма и молодежной политики Российской Федерации от 30.05.2011 года № 501 наименование дополнено словом «бюджетное» - Екатеринбургский филиал Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Уральский государственный университет физической культуры». Приказом Министерства спорта Российской Федерации от 20 августа 2012 года № 101 утверждены изменения в Устав УралГУФК и Положение о Екатеринбургском филиале УралГУФК. Приказом Министерства спорта Российской Федерации от 03 ноября 2015 года № 1007 утверждены изменения в Устав УралГУФК, наименование Университета и его структурного подразделения. Университет был переименован в Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждения высшего образования «Уральский государственный университет физической культуры».  Екатеринбургский филиал Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Уральский государственный университет физической культуры» был переименован в Екатеринбургский институт физической культуры (филиал) Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Уральский государственный университет физической культуры».

Поскольку в Екатеринбургском институте физической культуры имеется исторически сложившееся сочетание сильных специалистов, обширной инструментальной базы и стремления студентов к прикладной деятельности, в институте часто проводились конференции различного уровня, издавались сборники. Каждая из конференций, собирая значительное число участников, явно указывала на необходимость создания общего мероприятия и общего издания высокого уровня.

С приходом на должность заместителя директора по НИР доктора педагогических наук, профессора Брызгалова Игоря Вячеславовича процесс создания журнала получил мощный импульс. Авторитетная поддержка руководства института позволила в сжатые сроки определить концепцию журнала, способ издания, а также собрать под началом заместителя директора наиболее грамотных и глобально мыслящих специалистов из профессорско-преподавательского состава института.

Журнал «Научные и образовательные основы в физической культуре и спорте» стал тем общим знаменателем, благодаря которому работа в различных направлениях физкультурного образования может быть организована в единый процесс.